Winiarnia Cono Sur już od lat prowadzi ekologiczną politykę, konsekwentnie stosując metody ograniczające zużycie wody i energii elektrycznej oraz eksploatację winnic. Zamyka również swoje produkty w lżejszych butelkach, co umożliwia niższe zużycie paliwa podczas transportu gotowych produktów.
W 1998 roku firma podjęła decyzję o rezygnacji z rolnictwa tradycyjnego na rzecz zrównoważonego. Polega ono na stosowaniu naturalnych nawozów i zakłada stosowanie metod zwalczających szkodniki oraz choroby. Swobodnie bytujące gęsi, owce, owady i rośliny tworzą wspólnie samoregulujący ekosystem, dzięki któremu dojrzewające na plantacjach winogrona są nieskazitelnie czyste i zdrowe.
Cono Sur jest jedynym producentem wina w obu Amerykach, który spełnia wszystkie warunki kodeksu postępowania BSCI oraz posiada certyfikat ISO 14064-1. To czyni go liderem w dziedzinie ochrony środowiska. Jest również jedyną winiarnią w Chile mogącą pochwalić się Złotym Medalem Efektywności Energetycznej, przyznawaną przez tamtejsze Ministerstwo Energii.
Organiczne wina Cono Sur powstają wyłącznie z ekologicznych winogron. Ich hodowla oraz zbiory odbywają się w całkowicie naturalnych warunkach, bez jakiegokolwiek wykorzystania środków chemicznych czy sztucznych nawozów.
Projekt ekologicznej uprawy roślin rozpoczął się w 1999 roku. Początkowo hodowano je jedynie na 40 hektarach w winnicy Chimbarongo. Obecnie plantacje, na których dojrzewają winogrona wykorzystywane do produkcji linii Organic, posiadają tzw. korytarze biologiczne. Rozwiązanie to umożliwia swobodną egzystencję lokalnej florze i faunie – uprawa winorośli nie zakłóca bytowania drobnych roślin i zwierząt na terenie winnic.